無論什么東西都不是百分百完美的，膜結構建筑也是如此，膜結構建筑常見的質量問題主要分為以下三種。
1、褶皺 造成褶皺的原因很多，但大部分是由于設計、施工中預應力取值不當造成的。膜材是一種抗彎、抗壓剛度趨近于零的材料，在設計中進行找型分析、荷載分析，膜材不會產生褶皺。一般對于正在交異性的薄膜材料，當一個方向的主應變出現負值時，膜單元將出現單向褶皺狀態或全褶皺狀態。

2、色差 膜材在生產過程中需要在聚酯纖維織物或玻璃纖維織物的基材上涂以各種相應的涂層，以改善膜材的耐久性、抗水性、自潔性、抗紫外線燈物理性能。然而不同批次生產的膜材往往色澤存在一定差異，若將色澤差異明顯的膜材置于同一工程中必然影響美觀。

3、污漬 污漬也是在膜結構工程中常見的疵病，特別是在早期選用PV膜材建成的一些膜結構工程。原因主要是在設于膜材外用PVC涂層隨時間推移老化、剝落所致。由于制作安裝缺陷導致膜面在焊接縫處留下污漬或不慎利物刮劃涂層，使織物直接接受紫外線的作用，時間久了也會出現局部污漬。